Para derrubar uma organização criminosa e proteger Nova York, encare todas as aventuras junto das corajosas Tartarugas Ninjas. Comandando os quatro guerreiros, o jogador deverá enfrentar um grupo de inimigos que invadiram a cidade iniciando uma onda de crimes por onde passam. Durante as batalhas, será possível alternar entre Leonardo, Rafael, Michelangelo e Donatello, usando assim, o seu ninja preferido. Cada tartaruga conta com seu Ninjutsu, que podem ser combinados formando um ataque especial quando atacam o inimigo em grupo. Todo combate conta com suas missões e objetivos específicos. Ao completar as missões, o jogador ganha pontos de batalhas que podem ser trocados por itens para aprimorar as armas e golpes das Tartarugas. Escolha seu personagem favorito e acabe com os crimes da cidade em Mutants in Manhattan.
